Tilslutning af en CT til et beskyttelsesrelæ adskiller sig fra måleapplikationer på flere vigtige måder. Beskyttelsesrelæer kræver CT'er med specifikke nøjagtighedsklasser designet til at fungere lineært under fejltilstande, hvor primærstrømmene kan være mange gange den nominelle værdi. CT-sekundæren skal forbindes til relæets strømindgangsterminaler med korrekt polaritet for at sikre korrekt retningsbestemt og differentiel beskyttelsesfunktion.
De sekundære forbindelser S1 og S2 skal forbindes til relæklemmerne markeret henholdsvis k og l på kredsløbsdiagrammet -. For differentialbeskyttelsesordninger er polaritetsjustering kritisk. Strømmene, der kommer ind på begge sider af det beskyttede udstyr, skal tages i betragtning i forhold til deres retning. Når der opstår en fejl i faktisk drift, skal relæet kunne skelne mellem interne fejl og gennemgangsfejl, og denne skelnen afhænger helt af korrekt CT-polaritet og tilslutnings-.
I transformatordifferentialbeskyttelse skal forbindelsen af CT'er tage højde for faseforskydningen, der indføres af krafttransformatorens viklingskonfiguration. Hvis den primære transformatorvikling er delta-forbundet, er de primære CT'er typisk forbundet med stjerne; hvis den sekundære transformatorvikling er stjerne-forbundet, er de sekundære CT'er forbundet i delta. Dette kompenserer for 30 graders faseforskydning og sikrer, at strømmene, der kommer ind i relæet, er i fase under normale forhold-. Til mere komplekse situationer kan eksterne interposing-strømtransformere (IKT'er) bruges til at opnå det nødvendige forhold og fasekorrektion.
Jordfejlsbeskyttelsesordninger er også afhængige af specifikke CT-forbindelser. Direkte relæ kan give jordet-fasebeskyttelse ved hjælp af en CT med et forhold som 50/5 eller 10/1. Balancefluxrelæ registrerer jordet-fasestrøm ved hjælp af en doughnut-type CT installeret omkring de tre faseledere, hvor summen af strømmene normalt skal være nul. Restudkoblingsrelæ bruger reststrømmen afledt af de trefasede CT'er-.
Uanset beskyttelsesskemaet gælder de samme grundlæggende sikkerhedsregler: CT-sekundæren må aldrig efterlades åben, mens primærstrømmen løber, og sekundærkredsløbet skal være jordet på et punkt. Før ledningsføring skal CT-sekundæren-afbrydes ved at kortslutte den via en kortslutningsblok. Alle eksterne strømtransformers sekundærviklinger skal jordes til jordbussen, og CT-sekundærviklingerne må under ingen omstændigheder efterlades åbne-, når primærstrømmen løber. Efter installationen skal du kontrollere polariteten ved at observere relæets målte strømme under belastning eller ved at bruge en fase-vinkelmåler under idriftsættelse.